Onder de perrons langs de dokken is een 320 meter lange watergang of aquaduct. Dit aquaduct bestaat uit twee delen die samenkomen bij de scheiding tussen het kieldok en het timmerdok. Daar is een tussenkelder die het aquaduct verbindt met de vestinggracht.  Vanaf de oostelijke ingang van het aquaduct tot aan de tussenkelder is de vloer ca. 3.92 meter onder het maaiveld. Dat is gelijk aan gemiddeld laagwater. De vloer van de tussenkelder ligt lager (1.44 meter onder N.A.P.) met als doel dat zich daar water verzamelt dat afgevoerd kan worden naar de vestinggracht. Vanaf de tussenkelder loopt de gang op om vervolgens aan de westzijde op 3.76 meter onder het maaiveld te eindigen. Door dit verschil van 73 cm is de afvoer uit de watergangen makkelijker.

Aan het gehele dok is met grote zorgvuldigheid gewerkt. Duidelijk is dat te zien aan het metselwerk van het aquaduct. Het metselwerk is zeer gaaf en vaklieden staan versteld van het vakmanschap.

In de gewelven zijn 28 openingen, om water uit het aquaduct te putten. Plexiglas vervangt de eikenhouten luiken die de openingen afsloten.

In het westelijk dokhoofd is een gangetje dat het mogelijk maakte het aquaduct te vullen.